1-ю сумму бухгалтерия взять должна -- погашение основного долга льготируется в любом случае.
по 2-й ситуация спорная. С одной стороны, нет указания, что это именно проценты ЗА ПРОСРОЧКУ (не льготируемые) -- это могут быть просроченные основные проценты (льготируемые). Но на практике, скорее всего, будет отказ, т.к. бухгалтеру проблемы при проверке ради выплаты вам 13% от оспариваемой суммы не нужны от слова "совсем".
Если эти 13% от суммы "просроченных начисленных процентов" вам очень нужны -- либо ругаетесь с бухгалтером, либо берете в банке расшифровку/справку, в которой указано, что это не проценты за просрочку (возможно, платно).
ПС. Я знаю, что Platonic сейчас напишет, что это неверно. Но на практике дело обстоит именно так. Основной задачей бухгалтера является учет, анализ и экономия средств предприятия, а поиск возможностей "как выплатить работнику на 10 руб. больше" в большинстве случаев в его первоочередные задачи не входит, требует затрат времени бухгалтера больше, чем эти 10руб, и потому руководством не поощряется.