Очередное разъяснение по НДС еще раз показывает, что статья 141 НК как минимум сформулирована коряво, так как допускает двоякое толкование. А позиция МНС - это то, что "имелось ввиду" во время составления НК.
Видимо, пока остается только платить с небольшой вероятностью, что в будущем появятся иные разъяснения (что сомнительно) и уплаченный налог можно будет вернуть. Хотя с моей точки зрения проблема не в уплате налога, а в росте нагрузки по его администрированию, т.к. все эти ЭСЧФ и пересчеты потенциально съедят много времени.
Есть еще варианты - звонить на горячую линию зам. министра, обращаться в ассоциацию налогоплательщиков и пытаться через их каналы как-то проработать этот вопрос.
Наконец, как тут недавно отмечали, разъяснения можно оспорить, но для этого нужен инициативный гражданин с хорошим пониманием законодательства, способный грамотно оспорить такое толкование НК. В идеале - толковый юрист по налогообложению, который согласен с тем, что НДС ИП платить не должны в данном контексте.
Еще можно агитировать соответствующие иностранные организации встать на учет.
Возможно, что в какой-то момент НК претерпит изменения и по аналогии с российским ин. организации станут обязаны платить НДС сами в том числе и по работе с организациями, а не только ИП и физлицами, но это, как по мне, отдаленная перспектива, так как РБ слишком незначительна в торговом объеме, чтобы ин. организации были достаточно в этом заинтересованы (а терять поступления в бюджет, учитывая ситуацию в мире, у нас явно не захотят).