1) - Как выгодно ездить на городском транспорте и что по чем? Есть ли суточные проездные? Время работы?
Если вы хотите посмотреть много достопримечательностей за два дня и не тратить время на ходьбу, то конечно лучше брать проездной на два дня - 12 евро. По нашим меркам дорого, но в Амстердаме это равноценно билету в музей или же бюджетному обеду на двоих. Но по Амстердаму лучше все же гулять или на велосипеде как коренные. Ехать в плотном трафике велосипедистов - ухх как весело! 
Где и по чем можно взять в аренду авто?
Про это не подскажу, но думаю легко поддается гуглению. Авто вам понадобится разве что выехать загород, посетить скажем Лейден, Заандам или остров Маркен. В самом Амстердаме машин мало, да и парковки как правило дорогущие.
3) - Что и где посоветуете посетить, посмотреть, по каким ценам?
Во первых сам город с его интересной архитектурой и мостами. На самом крупном канале реки Амстел можно увидеть как разводят мосты и проплывают груженые баржи
Цветочный рынок можно посмотреть бесплатно, а также можно прикупить там сувениров
Кстати, дешевые магниты и всякая дребедень продается на блошином рынке на Waterlooplein.
В районе вокзала можно посетить Морской музей (15 евро) и научно-популярный центр NEMO (13.50 евро). В первом случае у вас есть шанс побродить по реплике большого торгового судна "Амстердам", а также посмотреть экспозиции глобусов, измерительных приборов и прочей морской аттрибутики. Nemo - зеленое здание необычной формы, похожее на корабль. Там собраны и объяснены разные научно-популярные явления из разных областей науки. Создан в первую очередь для детей, но для взрослых тоже очень-очень интересно. Можно даже самим провести какой-нибудь эксперимент!
Еще есть неплохой по европейским меркам Зоопарк Artis (€ 19,50), животных много, живут в хороших вольерах, слезы жалости не вызывает Есть интересный тропический павильон с живыми бабочками, летают вокруг и садятся на людей. Завораживает! Также в зоопарке есть небольшой планетарий, где каждые 40 мин показывают научно-популярные мультики прямо на полусферическом потолке. Ощущения необыкновенные! Также недалеко есть Ботанический сад (8.5 евро) - он небольшой, но интересный Есть также павильон с бабочками, павильон трех климатических зон.
Для любителей пива есть музей Хайнекен (15 евро), покажут старую пивоварню, покажут 5d фильм и угостят пивом
Для любителей прекрасного есть конечно же Рейксмузеум, музей Ван Гога, музей современного искусства Стеделек и так далее.
Помимо всего прочего есть много мелких музеев, которые попадаются по пути, вроде Кошачьего кабинета или что-то вроде.
Добавлено спустя 9 минут 46 секунд
4) - Как и где можно заказать обзорную экскурсию ( по городу и на кораблике по каналам)?
Можно взять круиз на кораблике - порядка 15 евро на человека, капитан как правило уточняет на каком языке вы говорите и выбирает нужное количество языков при плавании. Т.е. когда кораблик отчаливает, начинает вещать общий аудиогид на выбраных языках. Русский точно был! Да и капитаны как правило очень общительные
Также курсируют по городу автобусы по методу Hop on hop off, т.е. зашел, проехал, послушал аудиогид, можешь выйти и сесть на следующий, но автобус это скучно
5) - Чего стоит опасаться (наркоманы, воры, полиция, русские туристы..)
Наркоманов не видно, есть только релаксирующие с косяками с ворами надо быть бдительными в любом городе.
Не ходить по велодорожкам! Могут и сбить.
Также иногда бешено проносится то ли скорая помощь, то ли полиция. Когда переходишь дорогу - надо глядеть в оба. Но они, как правило, громко ревут, поэтому заметны издалека
Если есть еще вопросы, спрашивайте
